Inovácie sú vlastne základným motorom všetkého diania v ŠKODA AUTO. Zaoberá sa nimi veľké množstvo ľudí vo viacerých rôznych oddeleniach. Automobilka má aj vlastný tím inovačného manažmentu, ktorého úlohou je vyhľadávať a prinášať zákaznícke inovácie, teda novinky, ktoré sú skutočne praktické a zaujímavé pre zákazníka. Okrem toho by to mali byť novinky, ktoré sa starajú o to, že vozidlá ŠKODA idú s dobou alebo dokonca udávajú trendy.
Inovačný tím rieši rôzne detaily nových modelov i futuristických štúdií.
Práve vďaka inovačnému manažmentu sa zrodili inovácie ako napríklad škrabka na ľad vo veku nádrže, držiak tabletu pre cestujúcich na zadných sedadlách alebo lievik pre nalievanie kvapaliny do ostrekovačov integrovaný vo veku nádržky. Ale rovnako tak zložitejšie záležitosti ako napríklad aerodynamické kryty kolies, aktívne nastavovanie prívodu vzduchu k chladiču alebo generátor zvuku pre niektoré modely vozidiel ŠKODA.
Inovačný tím neustále skúša niečo nové, a to vrátane rôznych konceptov. K tým patrí napríklad pojazdná dobíjacia stanica pre elektromobily, ktorá využíva vodíkový palivový článok, elektrifikovaná náprava alebo nápady na využitie recyklovaných materiálov. Teraz tu pracujú s myšlienkou, ktorá má uľahčiť radenie vodičom automobilov s manuálnou prevodovkou.
Jedna z inovácií – integrovaný lievik v uzávere nádržky ostrekovačov čelného skla uľahčuje dopĺňanie kvapaliny do ostrekovačov.